炎症性肠病的遗传易感性在分子水平上是易感基因在起作用。

有许多研究集中在染色体6p 部位，该部位含有多种介导机体炎症反应的基因，包括主要组织相容性复合体。大量研究提示人白细胞抗原（HLA ) I 型和11 型与炎症性肠病的临床类型和肠外表现有关，尤其是溃疡性结肠炎患者。一些稀有的变异，如HLA DRBI * 0103 ，在正常人群中的比例为0.2％~3.2% ，而在溃疡性结肠炎患者中为6 ％~10 % ，在病变范围较广泛的溃疡性结肠炎患者中为15.8 % ，在极其严重的溃疡性结肠炎患者（需手术治疗）为14.1％~25 ％。HLA11 型基因与克罗恩病有某种程度的相关性，但结论不一致。

肿瘤坏死因子a ( TNFa ）是一种重要的促炎症因子和免疫调节因子，位于染色体6 夕1 ，在溃疡性结肠炎和克罗恩病患者的肠私膜、血清和粪便中检测TNF 一a 的水平，所有的研究均得出TNF 一a 蛋白质的产生和基因的表达存在异质性，表现在不同的克罗恩病或溃疡性结肠炎患者中，TNF 一a 产物的量或高或低。极近的研究表明，TNF 基因的多态性在克罗恩病的遗传易感性中的作用大于在溃疡性结肠炎中的作用。而TNF 缺陷的突变型小鼠NF 一KB 活性下降，对病原体入侵的易感性增加。在免疫反应和炎症反应的过程中，循环的淋巴细胞的相互作用依赖于一系列细胞间私附因子的作用。在溃疡性结肠炎和克罗恩病的结肠和血清中均发现细胞间私附因子1 ( ICAM 一l ）表达增高。亦有人研究发现，在患炎症性肠病人群中，ICAM 一1 的等位基因K49 出现的频率较正常人明显增多，提示炎症性肠病患者ICAM 一1 表达增多与遗传因素有关。

近来研究极为热门的问题是NODZ / CARD15 与克罗恩病发生的关系。克罗恩病患者的NODZ / CARD15 编码区域存在多态性能使克罗恩病发病危险性显著增加。当机体携带1 个NODZ 突变型基因时，克罗恩病的发病危险性就会增加2 倍。当同时携带2 个NODZ 突变型基因时，这种危险性就会增加20 一40 倍。不同形式的NODZ 突变可能和克罗恩病的病理损伤及｝！岳床表现有一定关系。研究者发现NODZ 突变型基因与回肠病变有显著相关性，而结肠受累无明显相关。

近来也有报道5 号染色体中的一些区域与克罗恩病的易感性有关。研究发现5 号染色体上某个区域存在细胞因子簇，能增加克罗恩病的易感性。杂合子和纯合子的患病危险性分别提高2 倍和6 倍。极近有关溃疡性结肠炎相关基因的研究显示，溃疡性结肠炎具有较高的遗传倾向，遗传基因表达失调，其发病涉及到免疫相关基因、凋亡相关基因、病变相关基因、遗传基因等诸多基因。极新的基因表达谱研究也显示溃疡性结肠炎与多种基因表达异常相关。