会引起腹泻的慢性疾病包括全身性疾病如糖尿病、甲考、肝脏疾病以及肠道本身的慢性病如肠病变及炎羞茬登病(克罗恩病和溃疡性结肠炎)、放射性肠炎、缺血，}生结肠炎、憩室炎、尿毒症性肠炎等。糖尿病患者因胃肠道神经病变引起胃肠功能紊乱．望譬胃泌素、胰高血糖素大量分泌致血糖升高，而‘高盖冀堂苎肠内细菌过度繁殖，亦可导致水、电解质紊巍，51起腹冯。 甲亢患者基础代谢率比正常人高很多，肠道的蠕动警皆号常人快很多，以致食物在肠道中停留时间过短，徘出未完全消化、吸收的物质，出现腹泻症状。肝病变患者常伴有肝硬化，造成门静脉高压或栓塞．导致肠壁淤血、水肿、蠕动加快、消化吸收与内分泌；乱，因而发生腹泻。乙肝等慢性病患者小肠内细菌过羞繁殖，分泌大量的肠毒素，促进肥大细胞增殖，释放组胺，使肠黏膜变性水肿及通透性增加，水分进入肠腔引起腹泻。

此外，肝病变患者胆盐缺乏，可致脂肪吸收障碍．再加上饮食不当，容易引起吸收不良性腹泻。大肠病变本身会有周lll的慢性炎症、肠道的分泌物增加，另外大肠病变常伴有出血等，同样可刺激肠道，引起慢性腹泻，并且有血液时很容易发生细菌等感染。克罗恩病和溃疡性结肠炎都属于炎症性肠病，它们不是因为感染，而是因为一些免疫系统功能的缺陷导的炎症性肠病，能引起节段性或连续性的肠道炎症．因此会腹泻。